Дык.... как тебе сказать то. как обычно. PHP старый (уязвим curl),
upload_max_filesize 2M
post_max_size 8M
тоже не особо радует
ffmpeg-php version 0.5.3.1
старенький
Apache/2.2.9
аналогично... А в чём настройка то заключается? по одному php.ini не определить нормально ли ты сервер настроил

дебиана

Это очень размытый вопрос) в идеале смотреть всё. абсолютно.

Потому что дебиан стабилен. и ПО там обновляют мягко говоря не быстро. У тебя есть два выхода:
1. искать более свежий репозиторий.
2. Компилять самому

Чувак, ты если взял свой сервер для хостинга, то надо наверное уметь с ним обращаться, нет?
Не получится вот так один раз настроить и больше не трогать.