Сразу скажу: substr скорее всего не поможет.

[php:1:a3be03cb18]
<?php
$str = "Hello
Noe!!!
Ok!";
//Нужно разбить $tr после 40-й строки
?>
[/php:1:a3be03cb18]

Как реализовать?
Есть ли функция, которая записывает строчку в массив применяя как разделитель \n?

Если это файл отдельный текстовой то сразу в массив загоняй $array=file('file.txt');